Par: Dr Emeka Enwere 

La civilisation humaine a été ponctuée, de temps à autre, d’interactions étroites, personnelles et souvent mortelles avec des organismes microscopiques. Ces microbes – appelés agents pathogènes, ou agents infectieux, ou simplement germes – sont responsables d’événements modérément notables comme la peste noire, la grippe de 1918, la variole et, plus récemment, l’épidémie d’Ebola. Au cours des 150 dernières années, nous avons dépensé des milliards de dollars et d’innombrables heures de recherche en laboratoire pour trouver de nouveaux et meilleurs médicaments et vaccins avec lesquels contrôler ces microbes. Il est sûr de dire que l’idée que “les microbes sont mauvais” est universellement imprimée dans la conscience humaine. 

Mais sont-ils vraiment si mauvais? 

Il s’avère que la réponse, à bien des égards, est non. 

La plupart des microbes sont en fait inoffensifs et beaucoup sont bénéfiques. Si vous deviez compter toutes les cellules du corps (sain), à l’intérieur comme à l’extérieur, vous constateriez qu’il y a autant de cellules microbiennes qu’il y a de cellules humaines. La plupart de ces microbes sont des bactéries qui vivent dans la muqueuse intestinale. Les bactéries intestinales normales jouent un rôle protecteur très important – elles empêchent la croissance de bactéries nocives, en leur faisant concurrence pour la nourriture et l’espace. L’élimination des bactéries normales de l’intestin le rend vulnérable à l’infection par des bactéries nocives qui n’auraient normalement aucune chance de survivre. 

C’est le cas, par exemple, lorsqu’une personne est infectée par Clostridium difficile. C. difficile, ou souvent simplement C. diff, est une bactérie qui provoque une gastro-entérite mortelle, avec des symptômes tels que douleur, diarrhée sévère, inflammation du côlon et insuffisance rénale. Paradoxalement, la plupart des gens contractent cette infection à l’hôpital, généralement juste après un traitement antibiotique. Le latin « difficile » dans le nom donne une idée de la difficulté à guérir l’infection. Avec un traitement normal – qui, ironiquement, consiste à administrer plus d’antibiotiques au patient – ​​l’infection à C. difficile a un taux de récurrence très élevé, laissant le patient jouer à un jeu de taupe avec un antibiotique après l’autre. Les antibiotiques ne sont pas très sélectifs dans le choix des bactéries à tuer; les bactéries intestinales normales meurent en même temps que les bactéries nocives, et il suffit de quelques bactéries C. difficile survivantes pour relancer toute la maladie. Par conséquent, l’un des moyens les plus efficaces de guérir définitivement une infection à C. difficile consiste à transplanter des bactéries normales dans l’intestin. Ces bactéries transplantées font ce que les antibiotiques ne peuvent pas faire: elles tuent les bactéries C. difficile et les empêchent de repousser. 

Les microbes qui vivent avec nous de façon plus ou moins permanente constituent le microbiote humain. Il existe environ 40 000 milliards de ces microbes, appartenant à un millier de familles différentes, et ils se trouvent dans presque toutes les parties du corps, y compris le cerveau. Leurs avantages commencent, littéralement, à la naissance. L’intestin du nourrisson est colonisé par des microbes sains pendant la naissance, où ils aident à enseigner au système immunitaire la différence entre les bonnes et les mauvaises bactéries. Ce processus est aidé par une protéine du lait, appelée lactoferrine, qui stimule les cellules immunitaires de l’intestin qui ont besoin d’être éduquées. Ces cellules “apprennent” ensuite les caractéristiques des bactéries intestinales normales et apprennent à ne pas réagir à ces bactéries. Ce processus d’entraînement tourne mal chez les nourrissons prématurés, où, sans à la fois le lait maternel et une dose de bactéries intestinales saines, le système immunitaire attaquera l’intestin lui-même. La condition est appelée entérocolite nécrosante, et est une cause majeure de mortalité chez les nourrissons prématurés. La supplémentation de ces nourrissons avec des bactéries et de la lactoferrine prévient à la fois l’entérocolite et l’infection par des microbes nocifs.^1,2 

Le microbiote intestinal a un autre rôle éducatif important, qui est d’informer le système immunitaire sur les allergènes. Cela se produit dans une fenêtre de temps étroite, généralement au cours des trois premières années de la vie, au cours de laquelle le système immunitaire peut être entraîné à considérer les squames, le pollen et d’autres allergènes comme de la “nourriture” ​​et les ignore généralement. Un microbiote intestinal sain et bien développé est nécessaire pour cet “entraînement à la tolerance”, tout comme, bien sûr, une grande exposition à ces allergènes. Dans une vaste étude canadienne sur le rôle du microbiote intestinal sur le développement de l’enfant, les chercheurs ont découvert qu’un microbiote peu développé chez des enfants aussi jeunes que trois mois prédisait le développement de l’asthme plus tard dans la vie.³ 

Les bénéfices d’un microbiote intestinal sain sont nombreux, mais encore mal compris; ce n’est que récemment que les progrès de la technologie génétique ont permis des recherches approfondies dans ce domaine. Jusqu’à présent, il est clair que l’influence du microbiote intestinal s’étend à tous les systèmes du corps. Il existe des preuves reliant l’intestin aux troubles métaboliques, aux maladies cardiovasculaires, aux troubles psychiatriques, aux troubles gastro-intestinaux, aux infections des voies respiratoires et même au cancer. Le microbiote intestinal pourrait être décrit comme le « deuxième génome » – des conditions telles que l’obésité peuvent être transmises par ces bactéries de la mère à l’enfant⁴, et même entre les individus⁵. Il est sûr de dire que pour mener une vie saine, vous devez prendre soin de vos bactéries. Ils prendront soin de vous aussi. 

Voici quelques conseils pour garder votre microbiote en bonne santé: 

• Maintenez une alimentation riche en fibres: les bactéries de l’intestin transforment les fibres en acides gras à chaîne courte (AGCC), qui ont de nombreux avantages pour la santé. Ils créent un environnement acide dans le côlon qui tue les bactéries nocives. Ils alimentent également la croissance et le maintien des cellules intestinales, suppriment l’inflammation. Ce sont également les agents actifs impliqués dans la formation du système immunitaire sur la différence entre les produits sains et nocifs. Les aliments riches en fibres comprennent les légumineuses (haricots et pois), les germes et les grains entiers. 
• Prenez des probiotiques: le bon probiotique peut aider à restaurer, soutenir et faire progresser votre microbiote intestinal, en protégeant contre les infections et l’inflammation chronique. 
• Détendez-vous: le stress perturbe l’équilibre des bactéries dans l’intestin, produisant des effets négatifs sur d’autres systèmes du corps.⁶ 

Les références  

1. Manzoni, P., Rinaldi, M., Cattani, S., Pugni, L., Romeo, MG, Messner, H., Stolfi, I., Decembrino, L., Laforgia, N., Vagnarelli, F., et al. (2009). Supplémentation en lactoferrine bovine pour la prévention de la septicémie tardive chez les nouveau-nés de très faible poids de naissance: un essai randomisé. JAMA 302: 1421–8. 

2. Meyer, M. P. et Alexander, T. (2017). Réduction de l’entérocolite nécrosante et amélioration des résultats chez les nouveau-nés prématurés après une supplémentation de routine en Lactobacillus GG en association avec la lactoferrine bovine. Journal de médecine néonatale et périnatale 10: 249-255. 

3. Arrieta, M.-C., Stiemsma, LT, Dimitriu, PA, Thorson, L., Russell, S., Yurist-Doutsch, S., Kuzeljevic, B., Gold, MJ, Britton, HM, Lefebvre, DL, et al. (2015). Les altérations microbiennes et métaboliques de la petite enfance affectent le risque d’asthme infantile. Science Translational Medicine 7: 307ra152-307ra152. 

4. Tun, H.M., Bridgman, S.L., Chari, R., Field, C.J., Guttman, D.S., Becker, A.B., Mandhane, P.J., Turvey, S.E., Subbarao, P., Sears, M.R., et al. (2018). Rôles du mode de naissance et du microbiote intestinal du nourrisson dans la transmission intergénérationnelle du surpoids et de l’obésité de la mère à la progéniture. JAMA Pédiatrie 172: 368. 

5. Fei, N. et Zhao, L. (2013). Un agent pathogène opportuniste isolé de l’intestin d’un humain obèse provoque l’obésité chez des souris sans germes. ISME Journal 7: 880–884. 

6. Gur, T.L., Worly, B.L. et Bailey, M.T. (2015). Stress et microbiote commensal: importance dans la parturition et le développement neurologique du nourrisson. Frontières en psychiatrie 6: 5.